La capture des oiseaux est pratiquée avec des filets japonais dans lesquels se prennent les oiseaux lors de leurs déplacements diurnes à basse altitude. Entre 900 et 6000 oiseaux sont capturés à chaque saison, depuis 1995. Ce programme a permis de récolter de l’information sur plusieurs espèces de passereaux et de pics nichant dans la zone boréale. La manipulation des oiseaux révèle des informations complémentaires à celles des relevés visuels et est nécessaire pour déterminer précisément le sexe, l’âge et la sous-espèce d’oiseaux en plumage automnal. Des ectoparasites et des échantillons de plumes peuvent être prélevés pour des études écologiques, taxinomiques et toxicologiques.

La capture et le baguage des oiseaux se fait près de la Maison des Dunes, dans le parc national du Saguenay. Le site de la Baie-du-Moulin-à-baude s'avère idéale pour l’installation de filets en raison de l’alternance d’espaces dégagés et de bosquets de végétation localisés en bordure du Saint-Laurent.

Démailler des dizaines d’oiseaux capturés représente tout un défi. De nombreux bénévoles sont donc appelés afin d’assurer le bon fonctionnement de ce programme et la sécurité des oiseaux capturés. L’OOT entend opérer tous les ans, une telle station de baguage avec le concours de partenaires financiers et de bénévoles.

Vous pouvez contribuer au maintien du programme de baguage de l'Observatoire d'oiseaux de Tadoussac en faisait un don pour Le Fonds des amis de l'OOT. L'équipe de l'OOT vous remercie pour votre soutien.

Le programme régulier de baguage de passereaux, instauré depuis 1996 permet la capture d'une cinquantaine d'espèces en moyenne. Toutefois, une très grande proportion de ces captures (parfois plus de 75% selon les années) est représentée par moins de 10 espèces. Parallèlement, plusieurs espèces qui sont observées en grand nombre dans le cadre du programme des relevés visuels, sont peu présentes voire absentes au niveau des données de baguage. Une des familles d'oiseaux la plus sous-représentée à l'échelle du baguage proportionnellement au nombre recensé est celle des Fringillidés. D'autres espèces typiquement boréales ont aussi été très peu capturées par le passé. Pour le Quiscale rouilleux et le Mésangeai du Canada, seulement 12 et 66 individus ont été bagués avant 2007. Afin d'obtenir davantage d'informations sur ces espèces, l'OOT a mis sur pied des projets dont l'objectif était d'élaborer de nouvelles techniques de capture spécifiques.

Entre 2001 et 2006, une attention particulière a été portée aux Pics à dos rayé et à dos noir, deux espèces peu connues, circonscrites à la forêt boréale, et reconnues comme étant d'excellents indicateurs de l'intensité des perturbations naturelles et industrielles du milieu forestier. La surveillance de la migration de ces pics existe à titre exploratoire depuis 1997. Effectué en collaboration avec le Dr Jacques Ibarzabal, professeur à l'Université du Québec à Chicoutimi, et chercheur au Consortium de recherche en forêt boréale commerciale, ce programme visait à décrire les mouvements de dispersion des jeunes pics à partir de la concentration en deutérium des plumes. Le deutérium est un isotope stable de l’hydrogène, qui se retrouve de façon naturelle dans les eaux de pluie et en concentration variable selon l’endroit où l’on se trouve. Une fois déposé au sol, cet isotope entre dans la chaîne alimentaire et s’accumule dans les tissus de tous les organismes, dont les oiseaux. Étant donné que les plumes des jeunes pics se renouvellent successivement durant la dispersion, leur signature chimique varie donc géographiquement, ce qui devrait nous révéler leur parcours migratoire.